大棚中不同的西紅柿品種，管理上是有區別的。主要有以下幾點：
      一、各種不同品種的栽培密度不同
      西紅柿有抗病毒與不抗病毒兩種，其中不抗病毒西紅柿品種在春季種植面積相對較大。采取適當密植、均勻栽培的方式，操作行適當窄一點，種植行稍寬一點，透光仍然很好，而且降低了棚內溫、濕度變化，可以預防裂果、皴皮。
      抗病毒品種是現在秋冬季節棚室栽培的主要品種。建議菜農不管是抗病毒品種還是不抗病毒品種，定植都不宜太密，避免造成枝葉郁閉，影響通風透光。要根據品種的特性，合理安排種植密度，長勢旺的適當稀植，長勢弱的適當密植，既要保證通風透光良好，又可保證較大的有效光合面積，才能提高棚室蔬菜整體產量。
      二、品種不同，蔬菜大棚施肥量與種類也有不同
      品種不同，長勢強弱也會有所不同，對肥料的的需求也存在一定的差異。很多抗病毒的品種植株長勢旺盛，但要求土壤肥力必須充足，否則植株長勢會明顯變弱，果形變小，嚴重影響產量和品質，所以，可以適當多用些有機肥。西紅柿對鈣等中微量元素的需求量較大，尤其是一些抗病毒品種，對缺素比較敏感，一旦吸收不足，臍腐病、青皮果等生理性病害就會發生，而且非常嚴重。建議菜農根據土壤肥力狀況合理配肥。
      三、整枝打叉方法不同   
      一些西紅柿長勢強，容易徒長，影響開花坐果，因此，不少菜農在西紅柿生長前期將植株歪倒，讓莖稈貼近地面生長，這樣可以有效控制植株旺長。一些抗病毒品種，則不必這么做。
      另外，在疏除側枝、摘葉、整枝打叉等方面，也要根據品種的特性，既要看植株長勢，也要考慮到果實成熟度、防病等多個方面，合理操作，才有利于獲得高產。
      四、不同品種的抗病性不同，所以在防病上也不同
      溫室大棚抗病毒西紅柿品種在抵御其他病害上大不如普通品種，對灰葉斑病、細菌性髓部壞死、潰瘍病等抵抗力差，發病嚴重。所以，菜農種植這些品種時要提前預防，減少病蟲害。